Die Kliniken des HELIOS Konzerns folgen strikt den evidenzbasierten Empfehlungen des Robert Koch-Instituts zur Krankenhaushygiene. Darüber hinaus existiert in den HELIOS Kliniken ein eigener, verbindlicher Leitfaden der Krankenhaushygiene mit einem Hygiene- und Desinfektionsplan, der stets den neuen wissenschaftlichen Erkenntnissen angepasst wird.

In der HELIOS Mariahilf Klinik Hamburg sorgt unter der Regionalen Leitung einer zu Fragen der Krankenhaushygiene und Infektionsprävention fortgebildeten Infektiologin – Dr. med. Kristina Biedermann, Fachärztin für Innere Medizin – eine speziell weitergebildete und geschulte Hygienefachschwester - Frau Susanne Renger - sowie hygienebeauftragte Ärzte und Ärztinnen in jeder klinischen Disziplin, sowie die Hygieneansprechpartner/Innen der Pflege für dessen Umsetzung. Ebenso wird auf die regelhafte Einhaltung der Maßnahmen des Infektionsschutzes  geachtet.

Die wichtigsten infektionsrelevanten und zum Teil multiresistenten Erreger, darunter auch der Erreger MRSA, werden täglich erfasst. Patienten mit Risikopotenzial werden außerdem bei ihrer Aufnahme im Krankenhaus auf bestimmte "mitgebrachte" Erreger (u.a. MRSA) untersucht.

Die einfachste und wichtigste Maßnahme zur Verhütung von Krankenhausinfektionen ist die Händedesinfektion vor und nach Patientenkontakt. Händedesinfektion hilft Menschenleben retten. Etwa eine halbe Million Menschen infizieren sich jedes Jahr in deutschen Krankenhäusern mit einer nosokomialen (im Krankenhaus erworbenen) Infektion. Fast 90 Prozent der vermeidbaren Krankenhausinfektionen, ca. ein Drittel der Krankenhausinfektionen sind nach entsprechenden Untersuchungen vermeidbar,  sind allein durch die korrekte Händedesinfektion zu beeinflussen. Hier legt HELIOS einen Schwerpunkt in seinem Hygienekonzept sowie bei der Ausbildung und Schulung seiner Mitarbeiter. Dass die Maßnahmen greifen, belegen die Zahlen: Seit der Einführung der konzernweiten Richtlinien sind die nosokomialen MRSA-Fälle bei HELIOS zurückgegangen. Sie liegen jetzt um 20 Prozent unterhalb des Durchschnittswertes der nationalen Referenzdaten (MRSA-KISS). Die Zahl der Händedesinfektionen (pro Patient und Tag) in den HELIOS Kliniken stieg währenddessen erheblich an.

Die HELIOS Kliniken sind Mitglied bei der deutschlandweiten Aktion „Saubere Hände“ sowie der deutschlandweiten Initiative KISS (Krankenhaus- Infektions- Surveillance- System = Erfassung nosokomialer Infektionen) des nationalen Referenzzentrums für nosokomiale Infektionen. Die HELIOS Mariahilf Klinik Hamburg nimmt bereits seit mehreren Jahren an verschiedenen KISS-Modulen teil. So werden zum Beispiel in einigen operativen Fächern Infektionen im Rahmen der Wundheilung, sowie nosokomiale Infektionen auf Intensivstationen registriert und auf Möglichkeiten der Vermeidung überprüft und in den entsprechenden Fachabteilungen ausgewertet.